Seniores
2004/05 - Campeão do Algarve II Divisão
2014/15 - Campeão do Algarve I Divisão
2015/16 - Vice Campeão II Div. Nacional Sul
2015/16 - Super Taça do Algarve
2015/16 - Finalista Taça do Algarve
2016/17 - 1/8 final Taça de Portugal
2016/17 - Finalista Taça do Algarve
2017/18 - Vice Campeão II Div. Nacional Sul
2018/19 - 1/8 final Taça de Portugal
2018/19 - II Divisão Nacional- Fase de Subida - 1º Classificado CAMPEÃO SUL
2018/19 - II Divisão Nacional - Apur. Campeão - VICE CAMPEÃO
2019/20 - Final Four - Taça de Portugal
2019/20 - I Divisão Nacional
2020/21 - Taça da Liga 1/4 Final
2020/21 - I Divisão Nacional 1/4 Final
Seniores Femininos
2017/18 - 1/2 Final Campeonato Distrital
2017/18 - Finalista Taça do Algarve
2017/18 - Vencedor da Taça Complementar
2018/19 - Supertaça do Algarve - Finalista Vencido
Juniores
2016/17 - Campeão do Algarve
2016/17 - Taça Nacional 2ºcl 2ªFase D
2017/18 - Supertaça do Algarve
2017/18 - Campeão do Algarve
2018/19 - Supertaça do Algarve - Finalista Vencido
Juvenis
2018/19 - Vice Campeão do Algarve
Iniciados
2018/19 - Taça do Algarve - Fase Final - Finalista Vencido
Infantis
2017/18 - 1/4 Final Campeonato Distrital
2018/19 - 1/2 Final Campeonato Distrital
Benjamins
2017/18 - Vice Campeão Distrital
2018/19 - Campeão Distrital
A modalidade foi implantada pela primeira vez no Portimonense na época de 2004/2005, tendo como principais responsáveis José Luís e Francisco Branco, sagrando-se campeão distrital da 2.ª Divisão no ano da estreia.
De 2005/2006 até 2008/2009 disputou o Campeonato Distrital da 1.ª Divisão, mas em junho de 2009 a secção foi extinta por falta de apoios.
Neste primeiro ciclo de 2004/2005 a 2008/2009, a secção contava apenas com seniores masculinos.
Em 2014/2015, pela mão de Pedro Moreira como responsável, secionista e treinador, o futsal voltou a fazer parte do Portimonense, vencendo a 1.ª Divisão Distrital do Algarve na primeira época.
A modalidade a partir de 2014/2015 foi completamente revitalizada e começaram a aparecer os vários escalões de formação, os Juniores fizeram a sua estreia em 2014/2015, os Benjamins, Petizes, Traquinas e Juvenis em 2015/2016 a que se juntaram os iniciados em 2016/2017.
Em 2015/2016 e na primeira época em que disputou a II Divisão Nacional, o Portimonense venceu a sua série e ficou apenas a um golo da subida à Primeira Divisão.
O sonho do mentor Pedro Moreira e do clube ainda foi adiado sempre "por uma negra" nas épocas seguintes, mas finalmente em 2018/2019 uma temporada incrível permite ao Portimonense a tão almejada subida ao escalão principal do Futsal Nacional.
Em 2019/2020, O Portimonense participa pela primeira vez na I divisão Nacional de Futsal, A Liga SportZone.